بررسی SNPهای مرتبط با چربی لاشه در گوسفندان نژادهای افشاری، مغانی و قزل

Authors

محمدباقر زندی استادیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

محمدطاهر هرکی نژاد دانشیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان

محمود پورعسکری دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی زنجان

Abstract:

شناسایی مناطق ژنومی کنترل کننده صفات اقتصادی، یکی از چالش برانگیزترین موارد استفاده از نشانگرهای متراکم در ژنتیک حیوانی است. شناسایی جایگاه‌های ژنی مرتبط با ذخیره چربی از لحاظ اقتصادی از اهمیت زیادی در پرورش گوسفند برخوردار است. در این تحقیق، از تعداد 49034 نشانگر تک نوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر ذخیره چربی برای 106 رأس گوسفند از نژادهای افشاری (37)، مغانی (34) و قزل (35) استفاده شد. نمونه‌ها با استفاده از آرایه‌های Illumina OvineSNP50K Beadchip تعیین ژنوتیپ شدند. با بررسی کنترل کیفیت نمونه‌های تعیین ژنوتیپ شده از 49034 نشانگر SNP تعداد 46676 باقی ماند. برای قرار گرفتن حیوانات در گروه-های نژادی خود از آنالیز مولفه‌های اصلی (PCA) براساس اطلاعات روابط خویشاوندی ژنومی استفاده شد. جهت بررسی تمایز جمعیتی در بین این سه نژاد از آماره‌های تتا و FST استفاده شد. در این مطالعه پنج ناحیه ژنومی که در صدک 99/99 کل ارزش‌های FST قرار گرفته بودند برای بررسی‌های بیشتر انتخاب شدند. این مناطق بر روی کروموزوم‌های 13، 3 (دوناحیه)، 15 و 22 واقع شده‌اند که با صفات فعالیت گیرنده لیپوپروتئین با چگالی پایین، اتصال اجزاء لیپوپروتئین با چگالی پایین، تنظیم لیپولیز در سلول‌های چربی و متابولیسم اسید چرب مرتبط می‌باشند. برای ارزیابی نشانه‌های انتخاب بر پایه روش‌های عدم تعادل لینکاژی از آزمون هموزیگوسیتی هاپلوئیدی بسط داده شده استفاده شد. استفاده از تراشه‌های ژنومی برای مطالعه تفاوت‌های ژنتیکی گوسفندان بومی و بررسی صفات اقتصادی مفید بوده که این امر می‌تواند به دست‌یابی برای بهبود ژنتیکی از طریق مطالعات همبستگی ژنوم و انتخاب ژنومی کمک کند.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

بررسی مقایسه ای ظرفیت تولید مثل چهار نژاد گوسفند بومی ایران 1- رشد‘ قدرت پرواز وخصوصیات لاشه

در این بررسی صفات وخصوصیات مربوط به رشد چهار نژاد گوسفند ایرانی (بلوچی ‘ شال‘ مغانی و افشاری) مورد مطالعه ومقایسه قرار گرفته است و برای انجام آن جمعا 175 سر بره نر وماده از چهار نژاد از تولد تا ده ماهگی تحت کنترل بوده اند .صفات مورد مطالعه بترتیب رشد جنینی ‘ رشد در دوران شیر خوارگی ‘ رشد پس از شیر خوارگی تا شروع پروار و رشد و چگونگی آن در دوره پرواربندی بوده است. نتایج حاصله از بررسی بشرح زیر ...

full text

مطالعه مورفومتریک و درون ریزی بیضه در نژادهای گوسفند قزل، مغانی و آمیخته های آنها با نژادهای کیوسی و سافولک

full text

بررسی تنوع ژنتیکی گوسفند نژادهای بومی (افشاری، قزل و مغانی) و خارجی (دورپر، مرینوس و رامنی) با استفاده از اطلاعات نشانگری متراکم

استفاده از نشانگرهای مولکولی در سالهای اخیر جهت تعیین تنوع ژنتیکی بین جمعیتها و گونههای مختلف جانوری کاربرد گستردهای یافته است. مطالعات ژنتیک مولکولی، مقایسه تنوع ژنتیکی درون و بین نژادها و بازسازی از تاریخ نژاد و جمعیت اجدادی را امکانپذیر مینماید .این تحقیق با بررسی ساختار ژنتیکی در نژادهای بومی و خارجی با استفاده از 50000 نشانگر SNP با هدف شناسایی تنوع ژنتیکی انجام شد. اطلاعات ژنوتیپی م...

full text

ارتباط پلی مورفیسم ژن fabp4 با چربی لاشه در گوسفندان آمیخته افشاری×برولامرینو

پروتئین متصل شونده به اسیدچرب (fabp) یک خانواده چند ژنی هستند که با برداشت، اکسیداسیون اسیدهای چرب و هموستازی متابولیک عمومی مرتبط می باشند. هدف از مطالعه حاضر شناخت چندشکلی ناحیه پروموتر و اگزون اول ژن fabp4 و ارتباط آن با صفات چربی و لاشه گوسفند بود. در این مطالعه 97 رأس بره نر آمیخته افشاری×برولا مرینو (نسل r1) با سن تقریباً یکسان از گله تحقیقاتی-آموزشی دانشگاه زنجان مورد استفاده قرار گرفتند....

15 صفحه اول